Né en Californie -il est ainsi également citoyen américain-, Andrej est le fils de l'ancienne star serbe Peja Stojakovic mais aussi d'une mère grecque. Il a joué pour Stanford, California et Illinois (13,5 points et 4,5 rebonds cette senior en tant que junior), et est l'objet de convoitises de la part de la Serbie et de la Grèce.
« Je rencontrerai les deux sélections nationales. Si j'estime être prêt à prendre la bonne décision, je la prendrai prochainement. Sinon, je continuerai d'attendre, » a t-il indiqué. « Je sais qu'il y a des qualifications cet été et que la Grèce et la Serbie sont intéressées par mon intégration dans leurs équipes. Mais si je dois choisir entre rester en NCAA ou jouer en NBA, cela signifie que je dois me concentrer sur mon développement et ma progression plutôt que de jouer pour une équipe nationale pour le moment. Je prendrai ma décision à ce moment-là. »
